IKDT GmbH Innovative Diagnostics

Expressionprofiling durch TaqMan Low-Density-Arrays (TLDA)

Nutzen Sie die TaqMan ® Low-Density-Arrays und bestimmen Sie quantitativ die Expression von 12 bis 384 Genen in einer Probe. Das Humane Genom ist sequenziert. Dank der TaqMan Gene Expression Assay-Technologie von Applied Biosystems können Sie für jedes humane Gen ein optimiertes TaqMan-QPCR-System sofort bestellen.

Diese einzelnen Systeme lassen sich auf dem neuartigen TaqMan ® Low-Density-Arrays (siehe Abb. A) in Sets von 8 x 48 humanen Genen (siehe Abb. B) frei wählbar gruppieren und erlauben die zeitgleiche und parallele Bestimmung der gewünschten Gene aus einer biologischen Probe. Diese quantitativen TaqMan ® Low-Density-Arrays sind auch für die Genexpression in Maus und Ratte verfügbar.

Einer der ersten Dienstleister europaweit

Als einer der ersten Dienstleister in Europa ermöglichen wir Ihnen den sofortigen Zugang zu dieser innovativen Technologie. Sie stellen Ihr gewünschtes Genset zusammen (dabei helfen wir Ihnen gern) und wir führen die Messung in unserem akkreditiertem Labor für Sie durch.

Was brauchen wir von Ihnen?
1. Benennung interessanter Gene für Ihr Problem

Was tun wir für Sie?
2. Auswahl Ihrer Gene für die TaqMan Low Density Array
3. Isolation der mRNA aus Ihrer Probe
4. Umschreiben der mRNA in cDNA
5. Durchführung der TaqMan-QPCR im IKDT
6. Übermittlung der Expressionsdaten an Sie
(Schritte 3 und 4 können auch durch Sie ausgeführt werden)

Vorteile für Sie:

- Optimierte TaqMan-QPCR Systeme für die Quantifizierung humaner Gene (derzeit ca. 200.000 Systeme verfügbar)
- Freie Kombination von bis zu 8 x 48 Ihrer krankheitspezifischen Gene (z.B. Tumoren, Stoffwechsel-Pathways)
- Sets auch für Maus und Ratte erhältlich
- schnell, preiswert und präzise

Weitere Informationen

Wir beraten Sie gern zu dieser innovativen Technolgie!
Weitere Informationen erhalten Sie über unseren Produktflyer:

TLDA-Flyer
(890KB, PDF-Format)

und unter:

Telefon: 030-8441 5540
Telefax: 030-8441 5555
E-Mail: genechips@ikdt.com

Expressions myokardialer Gene

Mit Hilfe der Micro-Fluidic-Card (Fa. Applied Biosystems) kann in RNA aus Herzmuskelbiopsien die Expression von bis zu 48 humanen, myokardialen Genen parallel in einer Messung quantitativ bestimmt werden. Diese quantitativen TaqMan Low-Density-Arrays (TLDAs) wurden bisher für die Fragestellung der DCM etabliert.

Analyse der microRNAs

microRNA (micros = griech. klein), abgekürzt miRNA, sind kurze Ribonukleinsäure (RNA)-Moleküle, die eine wichtige Rolle in dem komplexen Netzwerk der Genregulation, insbesondere beim Gen-Silencing spielen. Sie binden spezifisch an mRNA (messenger RNA) und kontrollieren die Genexpression durch Regulation der mRNA-Stabilität und der Translation. microRNAs wurden 1993 erstmals beschrieben, der Name wurde jedoch erst 2001 geprägt.

Die Gene für die miRNAs befinden sich im Genom. Die verschiedenen miRNAs werden durch ein komplexes Polymerase-Splicing-System im Zellkern gebildet, processiert, in das Zytosol transportiert und dort letzendlich mit einer Länge von 17 bis 24 Nukleotiden aus der pre-miRNA herausgeschnitten werden. Heutzutage sind bis zu 550 unterschiedliche microRNA-Sequenzen bekannt. Die maximale Anzahl humaner miRNAs wird auf ca. 1000 geschätzt.

Der Nachweis der sehr kurzen miRNAs kann direkt, nach entsprechendem Labeling mit speziellen Farbstoffen, mit DNA-Chips (z.B. Affymetrix, FEBIT) oder nach vorheriger Amplifikation mit der TLDA-Methode (Fa. Applied Biosystems) erfolgen. Für beide Methoden ist eine spezielle Processing der RNA-Proben empfehlenswert.

Das genomweite Screening auf exprimierte humane Gene muss 30.000 verschiedene mRNA erfassen und für den Vergleich von Proben die Expression jedes einzelnen Gens in beiden Proben bestimmen. Im Gegensatz hierzu werden von den bisher ca. 800 bekannten miRNAs nur eine limitierte Anzahl davon in einzelnen Geweben erwartet.

Das IKDT Labor bietet Ihnen schon heute die Möglichkeit micro-RNA-Profile mit der TaqMan-Technologie zu messen.

Serviceangebote Molekularbiologie:

Gewebefixierung (z.B. RNAlater) und Lagerung
Isolation von DNA und RNA aus diversen Geweben oder Blut
Umschreibung der mRNA in cDNA
Quantifizierung der Nukleinsäurefraktionen mit TaqMan QPCR
Bestimmung von Virusgenomen (nested-PCR, QPCR, Sequenzierung)
Messung der Genexpression von humanen, Maus- oder Rattengenen mit TaqMan QPCR
TaqMan Low-Density-Arrays - 12 bis 384 Gene aus einer Probe (Mensch, Maus, Ratte)
Messung von quantitativen Genprofilen auf der TaqMan Micro-Fluidic-Card
Messung von microRNAs
Genprofile werden durch den Nutzer definiert (z.B. Tumoren, Diabetes, Entzündung)
Entwurf kundenspezifischer Genarrays
Sequenzierung von PCR-Produkten oder Plasmiden
Fragmentanalysen zur Detektion von Polymorphismen oder Genvariationen
Nachweis krankheitsrelevanter single nucleotide polymorphisms (SNPs)
Set-up und Durchführung von neuen PCR-Systemen (Viren, Bakterien)
Übermittlung der Daten auch webbasiert möglich
Archivierung der Befunde, Gewebe und Nukleinsäuren nach GLP/GCP